Ο Μάρκο Μάριν στα 33 του αποφάσισε να εγκαταλείψει την ενεργό δράση και να επιστρέψει στον Ερυθρό Αστέρα, αναλαμβάνοντας το πόστο του επικεφαλής του τμήματος σκάουτινγκ της ομάδας του Βελιγραδίου.

Ο τελευταίος σταθμός της ποδοσφαιρικής καριέρας του Μάριν ήταν η Φερεντσβάρος, με την οποία είχε συμβόλαιο έως το καλοκαίρι. Ωστόσο, αποφάσισε να «κρεμάσει» τα ποδοσφαιρικά του παπούτσια.

Ο Μάριν έπαιξε από το καλοκαίρι του 2016 έως το 2018 στον Ολυμπιακό, όταν και έφυγε για τον Ερυθρό Αστέρα.